思路是将程序做为服务运行。
方法一：
创建服务：sc create “服务名" binpath=空格"X:\*.*(路径)"
删除服务：sc delete "服务名"
开启服务：net start "服务名"
关闭服务：net stop "服务名"
如：sc create "123" binpath= "C:\1.exe" 这就创建了一个名为"123"的服务路径为"C:\1.exe。开启它则运行 net start net start "123“ 要关闭也同理。删除则运行 sc delete “123”。
方法二：
使用Windows NT Resource Kit 提供的2个小工具：
Instrsrv.exe installs and removes system services from Windows NT.
Srvany.exe allows any Windows NT application to run as a service.
Instsrv.exe可以给系统安装和删除服务，Srvany.exe可以让程序以服务的方式运行，你可以到这里下载"Slyar_InstSrv_Srvany.rar"得到它们。下面我来说具体安装过程。
1、将Instsrv.exe和Srvany.exe放置到某目录下，下面用%path%代替路径
2、打开CMD，输入以下内容，其中ServerName为你要创建的服务名称
%path%\instsrv ServerName %path%\srvany.exe
3、打开regedit注册表编辑器，找到以下目录
HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\<ServerName>
4、鼠标右键单击<ServerName>，创建一个"项"，名称为"Parameters"
5、鼠标左键单击"Parameters"，在右边点击鼠标右键，创建一个"字符串值"(REG_SZ)，名称为"Application"，数值数据里填写你要执行的程序完整路径。
6(可选)、鼠标左键单击"Parameters"，在右边点击鼠标右键，创建一个"字符串值"(REG_SZ)，名称为"DependOnService"，数值数据里填写该服务依存的服务名称。不知道依存是什么的，你可以保持继续不知道，我不解释。
7、打开services.msc服务控制面板，找到<ServerName>，鼠标右键-属性-登陆，勾选"允许服务与桌面交互"(一般你要运行的程序都是有界面的吧)。
恩，一般这样就可以了。
补充：程序可以启动后，instsrv.exe可删除，srvany.exe不能删除（包括路径都不能删，不能动）
谢谢原作者，帮我解决了问题