【文件属性】:
文件名称:nmf的matlab代码-R_optimization_tutorial:R_optimization_tutorial
文件大小:15KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-26 16:53:07
系统开源
nmf的matlab代码R优化教程
本教程将向您展示如何调试和向量化R代码。
这些概念适用于其他语言,例如Matlab或Python。
运行示例需要两个库:
OCplus和RCurl
。
您可以通过键入以下命令来安装它们:
install.packages(
'
RCurl
'
)
source(
"
http://bioconductor.org/biocLite.R
"
)
biocLite(
"
OCplus
"
)
您的玩具问题:NMF聚类
我们将考虑对两个总体进行测量,每个测量有100个样本和50个数据点。
当将其应用于例如数据集时,它们分为两个不同的簇。
然后,我们的样本矩阵V可以由严格为非负数(即)的矩阵W*H近似,从而简化了结果的解释。
V.我们的数据矩阵,数据点在行(
k
)中,样本在列(
n
)中
H.一个k*n矩阵每一列都可以解释为样本,而每一行则可以解释为属于任一集群的权重。
W.
m*k矩阵。
每列都可以解释为群集的元签名。
假设我们不知道有两个聚类,我们想要一种全自动的方法来识别聚类的数量,并将每个样本的成员资格分配给给定的聚类。
我们可以使用不同的k值运行
【文件预览】:
R_optimization_tutorial-master
----nmfconsensus.R(11KB)
----public_html()
--------scores.php(27B)
--------index.php(18KB)
----README.md(9KB)
----Makefile(121B)
----.gitignore(35B)