本文参考：Android Studio NDK环境配置及JNI使用方法：http://blog.csdn.net/tongseng/article/details/53005123
并添加自己的实践：
1.前言
什么是NDK？
NDK全称是Native Development Kit，NDK提供了一系列的工具，帮助开发者快速开发C(或C++)的动态库，并能自动将so和Java应用一起打包成apk。NDK集成了交叉编译器（交叉编译器需要UNIX或Linux系统环境），并提供了相应的mk文件隔离CPU、平台、ABI等差异，开发人员只需要简单修改mk文件（指出“哪些文件需要编译”、“编译特性要求”等），就可以创建出so。
为什么使用NDK？
1. 代码的保护。由于apk的java层代码很容易被反编译，而C/C++库反汇难度较大。
2. 可以方便地使用现存的开源库。大部分现存的开源库都是用C/C++代码编写的。
3. 提高程序的执行效率。将要求高性能的应用逻辑使用C开发，从而提高应用程序的执行效率。
4. 便于移植。用C/C++写得库可以方便在其他的嵌入式平台上再次使用。
什么是JNI？
JNI的全称是Java Native Interface，它提供了若干的API实现了Java和其他语言的通信（主要是C和C++）。
为什么使用JNI？
JNI的目的是使java方法能够调用c实现的一些函数。
安卓中的so文件是什么？
Android中用到的so文件是一个C++的函数库。在Android的JNI中，要先将相应的C语言打包成so库，然后导入到lib文件夹*java调用。
Android Studio NDK及so文件开发
2. NDK安装及配置
NDK安装
Android Studio从1.3 Beta1开始，支持了NDK。之前则不支持，所以我们建议使用新版的编辑器。
如果未安装，点击安装下载；打开Tools->Android->SDK Manager->SDK Tools选中LLDB和NDK，点击确认，软件会自动安装NDK。
安装文件在：
将该路径配置到你系统变量的path里面去，如下：
然后将 NDK_ROOT追加到 Path环境变量下-->;%NDK_ROOT%
打开 cmd，输入 ndk-build，看看是否有东西输出。
3. JNI的使用方法
要先build一下project，具体方法为：Build->Rebuild Project。
>>相关阅读：Android Studio 新建 NDK Javah生成JNI头文件出现找不到类的错误
>>相关阅读：NDK-JNI实战教程（一） 在Android Studio运行第一个NDK程序
NDK下载：https://developer.android.com/ndk/downloads/index.html
第二种方法：NDK for Eclipse
本文参考：在eclipse中android NDK开发环境的搭建：http://blog.csdn.net/lovexieyuan520/article/details/43212333 以及 Eclipse下Android的NDK开发环境配置：http://www.cnblogs.com/pplxlee/p/5559223.html
网上有很多关于搭建Android NDK开发环境的文章，发现很多都不能用，大部分都是过时的，比如安装什么Cygwin，在eclipse里面新建什么Builder之类的，有的只有部分内容。经过一天的摸索终于搭建好了android NDK开发环境，包括C/C++的调试等，废话不多说，开始我们的搭建流程。
首先、下载android NDK，得到一个android-ndk-r10d-windows-x86_64.exe的安装文件，双击解压得到一个android-ndk-r10d的文件夹。安装android NDK，前提是你必须是安装android sdk，能够看到这儿，应该是已经安装android sdk了的，点击菜单Window-->Preferences-->Android-->NDK，在NDK Location中输入之前android-ndk-r10d的全路径，点击OK，截图如下：