详细请参考：http://wiki.ubuntu.org.cn/Gedit%E4%B8%AD%E6%96%87%E4%B9%B1%E7%A0%81
具体原因是Gedit的默认编码设置没有添加中文编码所以可以
通过gcof-editor（通过命令：sudo apt-get install gcof-editor 安装）在图形界面添加GB18030、GB2312、GBK、BIG5等简繁编码
或
通过命令
gsettings set org.gnome.gedit.preferences.encodings auto-detected "['GB18030','GB2312','GBK','BIG5', 'UTF-8', 'CURRENT', 'ISO-8859-15', 'UTF-16']"
添加。
这样就可以解决乱码问题了。