calibur处理ROSETTA输出的多个结构文件,clustering

时间:2023-03-09 16:53:19
calibur处理ROSETTA输出的多个结构文件,clustering

下载网址:https://sourceforge.net/projects/calibur/

安装:

 $ tar zxvf calibur.tar.gz
$ cd calibur
$ make

安装完成后,会产生calibur和calibur-lite两个可执行文件。

添加环境变量:

 $ vim ~/.bashrc
  #calibur
  export PATH=$Programs/calibur:$PATH
$ source ~/.bashrc

安装及配置完成。

用法:

1. 首先需要把所有pdb文件的名称制成一个列表;

 $ ls *.pdb > pdblist

2. 运行calibur;

 $ calibur pdblist       # 软件自行指定合适的阈值
$ calibur pdblist 1    # 自己指定阈值
$ calibur          # 打印帮助信息