【文件属性】：
文件名称：ViralSim:病毒模拟
文件大小：28KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-04-08 06:15:21
Python
病毒模拟
制作包装
出于性能原因，该软件包包括C扩展，需要对其进行构建。 将来，我们计划提供预构建的软件包，但是现在您需要自己构建它们。 为此，您需要一个有效的工具链来构建C ++代码（已知可以使用gcc和clang）。
您可以使用pip或conda 。 使用pip ，请执行以下操作（使用conda ，该过程应类似）：首先，安装依赖项
$ python -m pip install numpy>=1.19.5 cython
$ python -m pip install git+https://github.com/ev-br/mc_lib.git@v0.1
然后，构建C扩展，
$ python setup.py build_ext --inplace
而已！ 您现在可以运行模拟：
$ python ./ViralSim.py example/example.rt -it 10000
【文件预览】：
ViralSim-main
----setup.py(440B)
----.gitignore(821B)
----BirthDeathCython.pyx(33KB)
----fast_choose.pxi(2KB)
----LICENSE(34KB)
----IO.py(3KB)
----.github()
--------workflows()
----README.md(2KB)
----example()
--------example.su(322B)
--------example.rt(510B)
--------example.pp(173B)
--------example.mg(112B)
----mutations_popModel.pxi(4KB)
----BirthDeath.py(12KB)
----ViralSim.py(3KB)