【文件属性】：
文件名称：Phenological-shifts-germany
文件大小：3.37MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-04-10 05:21:33
R
物候转变德国
要求
软件：
R 4.0以上
RStudio 1.3 +（对于renv集成，如果没有Rstudio，您可能可以使其正常运行）
硬件：
内存不足8 GB可能无法使用
设置
下载存储库后，通过主目录中的Phenological Phenological-shifts-germany.Rproj在RStudio中打开项目。
renv应该会自动安装
要安装所有必需的软件包，只需调用renv::restore()
要运行分析，需要下载一些其他数据集并将其放置在static_data文件夹中：
植物授粉媒介互动数据集，为： : （需要登录，每个人都可以创建帐户）
来自生物群落的植物性状数据。 这应该是自动完成的，但是脚本会尝试解析每个物种当前接受的名称。 因此，稍后运行此脚本可能会导致分析中包含不同的物种。 分析中使用的原始数据集可应要求提供。
编码
从本文获得结果所需的
【文件预览】：
Phenological-shifts-germany-master
----.gitignore(263B)
----renv()
--------activate.R(10KB)
--------.gitignore(26B)
----static_data()
--------pollinator_taxa_all.txt(43B)
--------overall_mean_temperature.csv(10KB)
--------state_mean_temperature.csv(134KB)
--------last_keys.txt(96B)
--------data_citations.txt(935B)
--------excluded_institutions.txt(316B)
--------decadal_mean_temperature.csv(1KB)
----analysis_main.Rmd(111KB)
----.Rprofile(26B)
----assets()
--------Bee_and_Plant.png(676KB)
--------Hoverfly_and_Plant.png(696KB)
--------Hoverfly.png(481KB)
--------Butterfly_and_Plant.png(561KB)
--------Plant.png(152KB)
--------ampersand.png(4KB)
--------Bee.png(442KB)
--------Butterfly.png(285KB)
--------Beetle.png(200KB)
----Phenological-shifts-germany.Rproj(205B)
----scripts()
--------functions.R(50KB)
--------get_german_climate_data.R(4KB)
--------start_gbif_downloads.R(3KB)
--------get_occurrence_data.R(20KB)
--------plot_results.R(103KB)
--------plot_all_species_in_one.R(6KB)
--------get_bioflor_traits.R(10KB)
--------save_results_to_csv.R(33KB)
--------plot_occurrence_distribution.R(15KB)
----README.md(2KB)
----renv.lock(31KB)