【文件属性】：
文件名称：DEApp:DEAPP闪亮的应用程序
文件大小：1.82MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-19 04:10:52
R
DEApp：差异表达分析的交互式Web应用程序
什么是DEApp
此DE分析交互式Web应用程序（App）是用R和Shiny开发的，目标是1）。 使用edgeR，limma-voom和DESeq2进行差异表达（DE）分析，以及2）。 根据您提供的输入文件，使用这3种不同的DE分析方法对DE分析结果进行交叉验证。
如何使用它
要从github将本应用程序下载到本地PC后再运行该应用程序，请按照以下步骤操作：
如果是'Download ZIP'，则将下载的文件上拉到桌面，如果是通过git'克隆到桌面，则应将整个App文件夹（“ DEAPP-shiny”）下载到桌面。
使用R版本> = 3.2打开R或RStudio（如果已安装）。
将您的工作目录设置到该应用程序的解压缩或下载位置。
例如，我通过“下载ZIP”下载了该应用程序并将其解压缩到桌面，然后需要通过setwd("~/Deskto
【文件预览】：
DEApp-master
----.gitignore(29B)
----data()
--------ReadCounts-Chen-edgeRSpringer-multiFactor-meta.csv(183B)
--------pnas-count_singleFactor.txt(1.16MB)
--------ReadCounts-Chen-edgeRSpringer-multiFactor.csv(808KB)
--------pnas-count_singleFactor-meta.txt(95B)
----README.html(634KB)
----install()
--------prep.R(566B)
----LICENSE(18KB)
----.DS_Store(10KB)
----server.R(92KB)
----README.md(3KB)
----www()
--------Multi-dataInput2-exp2.txt(205B)
--------dataInput1-exp.txt(442B)
--------workflow.pdf(1.37MB)
--------dataInput2-exp0.txt(106B)
----ui.R(64KB)