【文件属性】:
文件名称:ngsxml:使用 XML 和 XSLT 生成工作流
文件大小:1.2MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-06-19 01:25:54
XSLT
动机
使用XML模型和XSLT转换为下一代测序构建一个简单的基于 Makefile 的工作流。
生成 Makefile 只需要像xmllint和xsltproc这样的标准工具。
要测试此工作流,只需键入
$ make
它将为下面的模型生成并运行一个新的 makefile。
例子
这是一个不言自明的数据模型示例
<? xml version = " 1.0 " encoding = " UTF-8 " ?>
< model xss=removed xss=removed xss=removed>
< project xss=removed>
< sample xss=removed>
< fastq>
< for>test/fastq/NA128
【文件预览】:
ngsxml-master
----.gitignore(110B)
----makefile.md(27KB)
----Makefile(1KB)
----LICENSE(11KB)
----doc()
--------test01.png(630KB)
----stylesheets()
--------model2make.xsl(22KB)
----README.md(7KB)
----xsd()
--------schema01.xsd(2KB)
----test()
--------fastq()
--------config()
--------ref()
--------model01.xml(1KB)